سروتونین به عنوان یک انتقال دهنده عصبی در سیستم عصبی مرکزی، که با اتصال به گیرنده‎های خود سبب تسهیل ارتباط بین سلول‎های عصبی می‎شود در کاهش یا افزایش دردهای میگرنی موثر می‎باشد. اتصال سروتونین به برخی گیرنده‎ها باعث میگرن و اتصال به برخی دیگر باعث پیشگیری از میگرن می‎شود. بدلیل نقش موثر سروتونین در بیماری میگرن، گیرنده‎های سروتونین بعنوان اهداف دارویی مهم به شمار می‎روند. پارتنولیـد موجود در کپسول میگراستوم، در رقابت با سروتونین به گیرنده‎های آن متصل شده و مانع از اتصال سروتونین می‎شود که با این مکانیسم کاهش درد میگرن اتفاق می‎افتد.⁴

مسیر سیگنالینگ NF-kB که یک فاکتور مهم در تنظیم التهاب است، به عنوان یک هدف تاثیرگذار برای مداخله دارویی به شمار می‎رود. پارتنولید با هدف قرار دادن IkB، مانع از تخریب IκB-α وIκB-β و فعال سازی NF-kB می‎شود که این مکانیسم باعث کاهش التهاب می‎شود. پارتنولید همچنین سنتز پروستاگلاندین‌ها که یکی از واسطه‌های التهاب می‌باشند را نیز مهار کرده و موجب کاهش التهاب می‌شود.² 

در بیماران مبتلا به میگرن به دلیل آزاد شدن سروتونین از پلاکت‎ها، تراکم و چسبندگی پلاکت‎ها نسبت به افراد سالم بیشتر اتفاق می‎افتد که منجر به انتشار سيتوکين‎های التهابی مانندIL-1 ، IL-6 ، IL-8  و TNF-a شده، و در نتیجه التهاب و سیگنال دهی درد افزایش می‎یابد. سزکویی‎ترپن‎های موجود در این کپسول به ویژه پارتنولید، با خنثی کردن گروه‎های سولفیدریل که با اتصال به آنزیم IkB موجب ترشح سروتونین شده و نقش مهمی در عملکرد و تجمع پلاکت‎ها دارند، ترشح سروتونین را مهار کرده و از بروز سردردهای میگرنی جلوگیری می‎کنند.